[صفحه اصلی ]   [Archive] [ English ]  
:: صفحه اصلي :: درباره نشريه :: آخرين شماره :: تمام شماره‌ها :: جستجو :: ثبت نام :: ارسال مقاله :: تماس با ما :: ::
:: دوره 6، شماره 2 - ( پاییز و زمستان 1400 ) ::
جلد 6 شماره 2 صفحات 94-85 برگشت به فهرست نسخه ها
اولین گزارش رخداد ویروس شکست رنگ گل شمعدانی (PFBV) از ایران و تعیین برخی ویژگی‌های مولکولی آن
حسین بیات ، مریم کریمی، شیدا بابایی
موسسه تحقیقات علوم باغبانی-سازمان تحقیقات آموزش و ترویج کشاورزی
چکیده:   (415 مشاهده)
شمعدانی  (Pelargonium spp.)از جایگاه مهمی در صنعت گل و گیاه جهان برخوردار بوده و یکی از محبوب‌‌ترین گیاهان برای استفاده داخل و خارج از خانه است. بیماری‌‌های ویروسی نقش مهمی در کاهش کمی و کیفی این گیاه زینتی دارند. در این بررسی 72 نمونه مشکوک به آلودگی ویروسی با نشانه‌هایی مانند لکه‌‌های روشن حلقوی، سوخته و زرد روی برگ و شکستگی رنگ گلبرگ و همچنین گیاهان بدون نشانه از گلخانه‌‌های مختلف منطقه‌‌ محلات و ورامین جمع‌‌آوری شدند. RNA نمونه‌‌‌‌های جمع‌‌آوری شده استخراج و در آزمون RT-PCR مورد ارزیابی قرار گرفتند. با استفاده از آغازگرهای عمومی تیره Tombusviridae، یک قطعه DNA با اندازه 500 جفت باز (bp) از 21 نمونه تکثیر شد. با تعیین توالی قطعه یاد­شده در دو جدایه ویروس و مقایسه با توالی‌‌های موجود در پایگاه داده‌‌های GenBank، وابستگی جدایه‌‌های یاد­شده به گونه Pelargonium flower break virus (PFBV) یا ویروس شکست رنگ شمعدانی آشکار شد. دوباره آزمون RT-PCR  با استفاده از  جفت آغازگر اختصاصی Ch1/Ch2 تکثیر کننده قطعه‌‌ای به طول  bp1500 از قسمت انتهای 3' ژنوم PFBV شامل ژن پروتئین پوششی (coat protein, CP) روی نمونه‌‌های مورد بررسی انجام گرفت که درستی نتایج مرحله قبل را تایید کرد. قطعه تکثیر شده سه جدایه برگزیده، از ژل استخراج و به­طور­مستقیم تعیین توالی شدند. واکاوی فیلوژنتیک براساس توالی آمینواسیدی ژن CP جدایه‌‌های برگزیده انجام شد و درختواره فیلوژنی با استفاده از روش neighbor joining رسم گردید. نتایج بررسی­های تبارزایی نشان داد که جدایه های PFBV گزارش شده از کشورهای مختلف در دو گروه قرار می‌‌گیرند و سه جدایه PFBV ایران در یک زیر گروه و جدا از زیر گروه‌‌های کشورهای دیگر قرار گرفتند. این نخستین گزارش از وجود PFBV از ایران می باشد.
واژه‌های کلیدی: تیره Tombusviridae، شمعدانی، شناسایی، گیاهان زینتی، ویروس
متن کامل [PDF 1393 kb]   (133 دریافت)    
نوع مطالعه: پژوهشي | موضوع مقاله: تخصصي
دریافت: 1400/4/16 | پذیرش: 1400/6/16 | انتشار: 1400/12/6
فهرست منابع
1. Albouy, J., Krczal, G., Lajoux, C. (1992). Influence of Pelargonium flower break virus (PFBV) and nepoviruses on Pelargonium production. In: VIII International Symposium on Virus Diseases of Ornamental Plants. Czech Republic, Prague, 55-62. [DOI:10.17660/ActaHortic.1994.377.4]
2. Alonso, M. Borja, M. (2005). High incidence of Pelargonium line pattern virus infecting asymptomatic Pelargonium spp. in Spain. European Journal of Plant Pathology, 112(2), 95-100. [DOI:10.1007/s10658-005-0803-1]
3. Bouwen, I., Maat, D.Z. (1992). Pelargonium flower-break and Pelargonium line pattern viruses in the Netherlands; purification, antiserum preparation, serological identification, and detection in pelargonium by ELISA. Netherlands Journal of Plant Pathology, 98(2), 141-156. [DOI:10.1007/BF01996326]
4. Dorion, N., Jouira, H.B., Gallard, A., Hassanein, A., Nassour, M., Grapin, A. (2010). Methods for In vitro Propagation of Pelargonium x hortorum and Others: From Meristems to Protoplasts. In: Jain, S. M., Ochatt, S. (Eds.), Protocols For In Vitro Propagation of Ornamental Plants, Humana Press, pp. 197-211. [DOI:10.1007/978-1-60327-114-1_19]
5. Franck, A., Loebenstein, G. (1992). Virus and virus-like diseases of pelargonium in Israel. In: VIII International Symposium on Virus Diseases of Ornamental Plants, Czech Republic, Prague, 31-40. [DOI:10.17660/ActaHortic.1994.377.2]
6. Khandan-Mirkohi, A., Kazemi, F., Babalar, M. Naderi, R. (2014). Effect of different levels of nitrogen in nutrient solution on the qualitative and quantitative traits of geranium (Pelargonium hortorum cv. Bulles eye). Journal of Crop Improvement, 16(1), 157-168 (In Persian).
7. Kumar, S., Stecher, G., Li, M., Knyaz, C., Tamura, K. (2018). MEGA X: molecular evolutionary genetics analysis across computing platforms. Molecular Biology and Evolution, 35(6), 1547. [DOI:10.1093/molbev/msy096]
8. Kusiak, C., Deogratias, J., Moreau, J. (1995). Transmission of pelargonium flower break virus (PFBV) in irrigation systems and by thrips. Plant Disease, 79(2), 163-166. [DOI:10.1094/PD-79-0163]
9. Masoomi-Aladizgeh, F., Jabbari, L., Khayam Nekouei, R., Aalami, A. (2016). A simple and rapid system for DNA and RNA isolation from diverse plants using handmade kit. Protocol Exchange, doi:10.1038/protex.2016.015 [DOI:10.1038/protex.2016.015]
10. Morozov, S.Y., Ryabov, E.V., Leiser, R.M., Zavriev, S.K. (1995). Use of highly conserved motifs in plant virus RNA polymerases as the tags for specific detection of carmovirus-related RNA-dependent RNA polymerase genes. Virology, 207(1), 312-315. [DOI:10.1006/viro.1995.1084]
11. Rasoulpour, R., Izadpanah, K. (2011). Isolation and partial characterization of Pelargonium leaf curl virus, Moroccan pepper virus and Eggplant mottled crinkle virus from plant and soil in Iran. Journal of Phytopathology, 159, 802-804. [DOI:10.1111/j.1439-0434.2011.01841.x]
12. Rasoulpour, R., Izadpanah, K. (2008). First report of Eggplant mottled crinkle virus in geranium in Iran. Plant Pathology, 57(2), 397. [DOI:10.1111/j.1365-3059.2007.01643.x]
13. Rico, P., Hernández, C. (2004). Complete nucleotide sequence and genome organization of Pelargonium flower break virus. Archives of Virology, 149(3), 641-651. [DOI:10.1007/s00705-003-0231-5]
14. Rico, P., Ivars, P., Elena, S.F., Hernández, C. (2006). Insights into the selective pressures restricting Pelargonium flower break virus genome variability: evidence for host adaptation. Journal of Virology, 80(16), 8124-8132. [DOI:10.1128/JVI.00603-06]
15. Rosa, C., Moorman, G.W. (2018). Diseases of Geranium. In: McGovern, R.J., & Elmer, W.H. (Eds.). Handbook of Florists' Crops Diseases. Springer, pp 941-974. [DOI:10.1007/978-3-319-39670-5_34]
16. Saidi, A., Safaeizadeh, M. (2011). First report of Cucumber mosaic virus infecting geraniums (Pelargonium spp.) in Iran. Asian Journal of Plant Pathology, 5, 163-165. [DOI:10.3923/ajppaj.2011.163.165]
17. Scheets, K., Jordan, R., White, K.A., Hernández, C. (2015). Pelarspovirus, a proposed new genus in the family Tombusviridae. Archives of Virology, 160, 2385-2393. [DOI:10.1007/s00705-015-2500-5]
18. Stone, B.O.M., Hollings, M. (1973). Some properties of pelargonium flower break virus. Annals of Applied Biology, 75(1), 15-23. [DOI:10.1111/j.1744-7348.1973.tb01332.x]
19. Wei, M.S., Li, G.F., Ma, J., Kong, J. (2015). First report of Pelargonium flower break virus infecting Pelargonium plants in China. Plant Disease, 99(5), 735. [DOI:10.1094/PDIS-11-14-1128-PDN]
20. Albouy, J., Krczal, G., Lajoux, C. (1992). Influence of Pelargonium flower break virus (PFBV) and nepoviruses on Pelargonium production. In: VIII International Symposium on Virus Diseases of Ornamental Plants. Czech Republic, Prague, 55-62. [DOI:10.17660/ActaHortic.1994.377.4]
21. Alonso, M. Borja, M.(2005). High incidence of Pelargonium line pattern virus infecting asymptomatic Pelargonium spp. in Spain. European Journal of Plant Pathology, 112 (2), 95-100. [DOI:10.1007/s10658-005-0803-1]
22. Bouwen, I., Maat, D. Z. (1992). Pelargonium flower-break and Pelargonium line pattern viruses in the Netherlands; purification, antiserum preparation, serological identification, and detection in pelargonium by ELISA. Netherlands Journal of Plant Pathology, 98(2), 141-156. [DOI:10.1007/BF01996326]
23. Dorion, N., Jouira, H. B., Gallard, A., Hassanein, A., Nassour, M., Grapin, A.( 2010). Methods for In vitro propagation of Pelargonium x hortorum and others: From Meristems to Protoplasts. In: Jain, S. M., Ochatt, S. (Eds.) Protocols For in vitro Propagation of Ornamental Plants, Humana Press, pp. 197-211. [DOI:10.1007/978-1-60327-114-1_19]
24. Franck, A., Loebenstein, G. (1992). Virus and virus-like diseases of pelargonium in Israel. In: VIII International Symposium on Virus Diseases of Ornamental Plants, Czech Republic, Prague, 31-40. [DOI:10.17660/ActaHortic.1994.377.2]
25. Khandan-Mirkohi, A., Kazemi, F., Babalar, M. Naderi, R. (2014). Effect of different levels of nitrogen in nutrient solution on the qualitative and quantitative traits of geranium (Pelargonium hortorum cv. Bulles eye).Journal of Crop Improvement, 16 (1), 157-168 (In Persian).
26. Kumar, S., Stecher, G., Li, M., Knyaz, C., Tamura, K. (2018). MEGA X: molecular evolutionary genetics analysis across computing platforms. Molecular biology and evolution, 35(6), 1547. [DOI:10.1093/molbev/msy096]
27. Kusiak, C., Deogratias, J., Moreau, J. (1995). Transmission of pelargonium flower break virus (PFBV) in irrigation systems and by thrips. Plant Disease, 79(2), 163-166. [DOI:10.1094/PD-79-0163]
28. Masoomi-Aladizgeh, F., Jabbari, L., Khayam Nekouei, R., Aalami, A. (2016). A Simple and Rapid System for DNA and RNA Isolation from Diverse Plants Using Handmade Kit. Protocol exchange, doi:10.1038/protex.2016.015 [DOI:10.1038/protex.2016.015]
29. Morozov, S. Y., Ryabov, E. V., Leiser, R. M., Zavriev, S. K. (1995). Use of highly conserved motifs in plant virus RNA polymerases as the tags for specific detection of carmovirus-related RNA-dependent RNA polymerase genes. Virology, 207(1), 312-315. [DOI:10.1006/viro.1995.1084]
30. Rasoulpour, R., Izadpanah, K. (2011). Isolation and partial characterization of Pelargonium leaf curl virus, Moroccan pepper virus and Eggplant mottled crinkle virus from plant and soil in Iran. Journal of Phytopathology, 159, 802-804. [DOI:10.1111/j.1439-0434.2011.01841.x]
31. Rasoulpour, R., Izadpanah, K. (2008). First report of Eggplant mottled crinkle virus in geranium in Iran. Plant Pathology, 57 (2), 397. [DOI:10.1111/j.1365-3059.2007.01643.x]
32. Rico,P., Hernández, C. (2004). Complete nucleotide sequence and genome organization of Pelargonium flower break virus. Archive of virology, 149(3), 641-651. [DOI:10.1007/s00705-003-0231-5]
33. Rico, P., Ivars, P., Elena, S. F., Hernández, C. (2006). Insights into the selective pressures restricting Pelargonium flower break virus genome variability: evidence for host adaptation. Journal of Virology, 80(16), 8124-8132. [DOI:10.1128/JVI.00603-06]
34. Rosa, C. Moorman, G.W. (2018). Diseases of Geranium. In: McGovern, R. J., & Elmer, W. H. (Eds.). Handbook of Florists' Crops Diseases. Springer, pp 941-974. [DOI:10.1007/978-3-319-39670-5_34]
35. Saidi, A., Safaeizadeh, M. (2011). First report of Cucumber mosaic virus infecting geraniums (Pelargonium spp.) in Iran. Asian Journal of Plant Pathology, 5, 163-165. [DOI:10.3923/ajppaj.2011.163.165]
36. Scheets, K., Jordan, R., White, K. A., Hernández, C. (2015). Pelarspovirus, a proposed new genus in the family Tombusviridae. Archives of virology, 160, 2385-2393. [DOI:10.1007/s00705-015-2500-5]
37. Stone, B. O. M., Hollings, M. (1973). Some properties of pelargonium flower break virus. Annals of Applied Biology, 75(1), 15-23. [DOI:10.1111/j.1744-7348.1973.tb01332.x]
38. Wei, M. S., Li, G. F., Ma, J., Kong, J. (2015). First report of Pelargonium flower break virus infecting Pelargonium plants in China. Plant Disease, 99(5), 735. [DOI:10.1094/PDIS-11-14-1128-PDN]
ارسال پیام به نویسنده مسئول

ارسال نظر درباره این مقاله
نام کاربری یا پست الکترونیک شما:

CAPTCHA



XML   English Abstract   Print


Download citation:
BibTeX | RIS | EndNote | Medlars | ProCite | Reference Manager | RefWorks
Send citation to:

Bayat H, Karimi M, Babaei S. First report of Pelargonium flower break virus (PFBV) in Iran and determining some of its molecular properties. FOP. 2021; 6 (2) :85-94
URL: http://flowerjournal.ir/article-1-203-fa.html

بیات حسین، کریمی مریم، بابایی شیدا. اولین گزارش رخداد ویروس شکست رنگ گل شمعدانی (PFBV) از ایران و تعیین برخی ویژگی‌های مولکولی آن. گل و گیاهان زینتی. 1400; 6 (2) :94-85

URL: http://flowerjournal.ir/article-1-203-fa.html



بازنشر اطلاعات
Creative Commons License این مقاله تحت شرایط Creative Commons Attribution-NonCommercial 4.0 International License قابل بازنشر است.
دوره 6، شماره 2 - ( پاییز و زمستان 1400 ) برگشت به فهرست نسخه ها
گل و گیاهان زینتی Flower and Ornamental Plants
Persian site map - English site map - Created in 0.05 seconds with 29 queries by YEKTAWEB 4419